正常的子宫内膜在子宫腔内，但当子宫内膜的腺体和间质组织出现在子宫腔外时，就会出现子宫内膜异位症。
异位的子宫内膜生长在卵巢中，每个月像月经一样有规律地出血，形成单个或多个充满旧血的囊肿，随着时间的推移变成浓稠的咖啡色液体，类似于巧克力，因此被称为 "巧克力囊肿"。
如果卵巢囊肿较小，而腹腔镜手术不是一种选择，可以进行子宫输卵管造影。如果需要手术或辅助受精，必须确定卵巢储备。血液中的抗苗勒氏管激素（AMH），基础性激素和窦卵泡数量（AFC）。
IRM苏州试管婴儿中心的专家Juliova博士说，对于卵巢储备正常、年轻且卵巢囊肿较小（直径小于4-5厘米）的不孕妇女，必须排除不孕因素，积极尝试怀孕一年，同时监测卵巢囊肿的大小；对于怀疑有子宫内膜异位症和卵巢囊肿的不孕妇女，首选腹腔镜手术。在手术后，辅助生殖技术被用来帮助受孕。
IRM苏州试管婴儿中心的专家Juliova博士说，对于卵巢功能不佳、卵巢小囊肿或复发性子宫内膜异位症的老年妇女，要积极采用辅助生殖技术帮助受孕，GnRH-a可作为受孕前的预处理。早期手术适用于直径大于4-5厘米的卵巢囊肿，或扩大的囊肿和怀疑其他卵巢肿瘤。